SIMANJUNTAK, OKTAVIA FRIMA SION and Syakti, Agung Dhamar and Aryati, Yani (2025) IDENTIFIKASI BAKTERI TERKULTUR (CULTIVABLE) DARI SEDIMEN MANGROVE DENGAN TEKNIK KONVENSIONAL DAN BIOMOLEKULER. S1 thesis, Universitas Maritim Raja Ali Haji.

	Text (Cover) OKTAVIA FRIMA SION SIMANJUNTAK_2102010004_Ilmu kelautan_ Cover.pdf - Published Version Download (464kB)
	Text (Abstrak) OKTAVIA FRIMA SION SIMANJUNTAK_2102010004_Ilmu kelautan_Abstrak.pdf - Published Version Download (134kB)
	Text (BAB I) OKTAVIA FRIMA SION SIMANJUNTAK_2102010004_Ilmu kelautan_BAB I.pdf - Published Version Download (149kB)
	Text (Daftar pustaka) OKTAVIA FRIMA SION SIMANJUNTAK_2102010004_Ilmu kelautan_Daftar pustaka.pdf - Published Version Download (346kB)
	Text (Full Teks) OKTAVIA FRIMA SION SIMANJUNTAK_2102010004_Ilmu kelautan_Full Teks.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (2MB) | Request a copy

Abstract

RINGKASAN OKTAVIA FRIMA SION SIMANJUNTAK. Identifikasi Bakteri Terkultur (Cultivable) dari Sedimen Mangrove dengan Teknik Konvensional dan Biomolekuler. Dibimbing oleh Prof. Dr. Agung Dhamar Syakti, S.Pi, DEA dan Dr. Yani Aryati, M.Si. Sebagai salah satu ekosistem pesisir, mangrove memiliki peran dan fungsi penting secara ekonomis, biologis dan ekologis. Namun dalam beberapa dekade terakhir ekosistem mangrove menghadapi tekanan signifikan dari berbagai masukan limbah antropogenik yang berdampak pada terganggunya keberlangsungan fungsi ekosistem mangrove. Kondisi tersebut dapat ditanggulangi dengan memanfaatkan bakteri sebagai agen bioremediasi ramah lingkungan untuk mendegrdasi berbagai polutan. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi bakteri yang dapat dikultur dari sedimen mangrove di Perairan Pengudang dan Dompak dengan menggunakan kombinasi teknik konvensional dan biomolekuler. Penelitian ini dilakukan pada bulan September 2024 hingga Januari 2025, di Laboratorium Bakteriologi dan Mikrobiologi Lingkungan, Pusat Penelitian Mikrobiologi Terapan, BRIN Cibinong, Bogor - Jawa Barat. Penentuan stasiun penelitian dilakukan dengan metode purposive sampling dan pengambilan sampel sedimen menggunakan metode grab sampling yang dilakukan pada saat surut yang diulang sebanyak 4 titik sampling di setiap stasiunnya dengan jarak 10 m antar titik pengambilan sampel. Alat dan bahan yang digunakan meliputi cawan petri, jarum ose, inkubator, laminare air flow, mikroskop, nanodrop, thermocycler, elektroforesis apperatur, larutan NaCl, media NA, larutan KOH 3%, CTAB-Kloroform, master mix, dan primer 16S rRNA. Analisis data dilakukan dengan menghitung densitas koloni bakteri (CFU/mL), mengukur konsentrasi DNA, menganalisis hasil sekuens 16S rRNA menggunakan platform EzBioCloud dan merekonstruksi pohon filogenetik menggunakan software MEGA 11. Berdasarkan hasil penelitian diperoleh 13 isolat bakteri terkultur yang telah teruji potensinya, dengan morfologi koloni bervariasi meliputi bentuk circular hingga irregular, warna putih hingga cream kekuningan dan cream keputihan , margin curled, entire hingga endulate, dan elevasi flat, convex dan unbonate dengan morfologi sel yang didominasi oleh bentuk basil yang terdiri dari 10 isolat gram positif dan 3 isolat gram negatif serta berdasarkan hasil analisis gen 16S rRNA didapatkan bahwa seluruh isolat memiliki tingkat kemiripan 100% terhadap spesies referensi diantaranya isolat P.1-A teridentifikasi sebagai B. mycoides, P.1-B : P. megaterium, P.1-E : P. flexa, P.1-H : L. xylanilyticus, P.1-I : B. pseudomycoides, P.2-C : B. paramycoides, P.2-L2 : P. aryabhattai, P.3-B : S. perfectomarina, P.3-H : N. farcinica, P.3-K : B. anthracis, P.4-O : P.espejiana, D.1-O : P. fulvigenes, dan isolat D.3-N yang teridentifikasi sebagai B. altitudinis. Keragaman bakteri terkultur dengan spesies yang teridentifikasi ini menunjukkan potensi biodegradasi polutan dan peluang dalam aplikasi bioteknologi berkelanjutan. Kata kunci: Bakteri terkultur, Sedimen Mangrove, Sekuensing 16S rRNA, Teknik Biomolekuler, Teknik Konvensional.

Actions (login required)

View Item